İki yıl sonra, Ethan Hunt Solomon Lane'i yakaladıktan sonra, Syndicate'in artıkları başka bir örgüt olan Apostles olarak yeniden şekillendi. Gizemli bir dindar olan sadece John Lark olarak bilinen bir liderlik altında, örgüt üç plutonyum çekirdeği elde etmeyi planlıyor. Ethan ve ekibi onları engellemek için Berlin'e gönderilir, ancak Ethan Luther'ı kurtarırken ve Apostles plutonyumla kaçarken görev başarısız olur. CIA ajanı August Walker ekibe katıldığında, Ethan ve müttefikleri şimdi plutonyum çekirdeklerini çok geç olmadan bulmak zorundadır. Plutonyum çekirdeklerini ele geçirmek, dünya çapında yıkıcı bir krize yol açabilir.